Foi um dos primeiros discípulos arregimentados por Santo Inácio de Loyola e estava entre os fundadores da Companhia de Jesus (na pintura ao lado, Santo Inácio, de pé, recebe São Francisco Xavier, de joelhos, na Companhia de Jesus).Pregou na Índia, no Japão e em outras nações do Oriente. Converteu e batizou muitos milhares de pagãos e praticou milagres portentosos.
Faleceu aos 46 anos de idade, no momento em que se aproximava das costas da China, que pretendia conquistar para Nosso Senhor Jesus Cristo.
É o patrono dos missionários católicos.